Отчет Счетной палаты Российской Федерации об администрировании налога на доходы физических лиц за период 2016–2018 гг. выявил тенденцию недоиспользования регионами права предоставлять льготы по налогам.
Так, орган аудита установил, что в течение указанного отрезка времени ни один регион не обеспечил дополнительные имущественные и социальные вычеты, лишь 4 региона (из 85) уменьшили срок владения имуществом, позволяющий собственнику не уплачивать налог после его продажи, до 3 лет, а могли до 0. При этом всего восемь регионов составили дополнительный список услуг, не подлежащих налогообложению при условии предварительного уведомления налоговой службы.
Кроме того, как подметил в феврале 2019 г. президент, очень медленно вводится инвестиционная налоговая льгота, призванная развивать инвестиционную деятельность. За год ее применили только 10 (к концу года более 40) регионов.
Специалисты S&P; утверждают, что финансовая система на уровне регионов нестабильна и разбалансирована, поскольку, оказывая поддержку регионам в денежном плане, правительство ежегодно вносит изменения в налоговую систему, при этом необходимо понимать, что налоги составляют практически 70 % их доходов. Помимо прочего, Министерство финансов постоянно ужесточает правила погашения регионального долга (ист.: директор Fitch Владимир Редькин), что является первостепенным для регионов.
Наибольший объем льгот (за счет собственных ресурсов) предоставляют Москва, Санкт-Петербург и ХМАО.
